1、卵巢囊肿导致不孕
卵巢是卵子发育、成熟、排出的场所，而各个不同阶段的卵泡在卵巢皮质，若卵巢遭受到破坏，使卵子发育、成熟及排出受损，就会导致不孕。卵巢囊肿属于卵巢肿瘤的一种，其引起不孕的机制与干扰排卵功能有关。某些含有内分泌功能的卵巢囊肿，如卵巢甲状腺瘤、卵巢颗粒—卵泡膜细胞瘤、睾丸母细胞瘤等，可因其所含肿瘤组织成分不同而产生某些相应激素，从而干扰了卵巢激素的正常分泌和排卵，出现闭经，子宫出血，多毛和不孕等症状。
2、卵巢囊肿导致流产
若在妊娠3个月内发现患有卵巢囊肿，进行处理时容易引起流产，如果妊娠期间发现患有双侧卵巢囊肿，在手术处理中若触动子宫，则可引起流产，妊娠28周以后发现患有卵巢囊肿者，手术中极易引起早产，如在妊娠末期发现患有卵巢囊肿，则妨碍分娩，引起尿潴留或阻塞性难产。卵巢囊肿的蒂扭转，破裂或疑为恶性，不论在妊娠的任何时期均应尽速治疗。否则会产生严重后果。