早春怀孕的胎儿发生畸形主要因素是孕妇的病毒感染。春季空气湿度大，温度逐渐升高，有利于各类病毒的复制和生长，病毒性疾病在人群中广泛迅速的流行增加了孕妇的感染机会。如早孕期内患风疹病毒感染，则会引发胎儿先天性心血管畸形，常见的有动脉导管未闭、肺动脉瓣狭窄和周围肺动脉狭窄;还可以发生白内障、聋哑等先天畸形。巨细胞病毒感染是引起先天性精神障碍的主要原因，可引起永久性的脑损伤。脊髓灰质炎病毒、流行性腮腺炎病毒、流感病毒、水痘病毒、疱疹病毒等也可经胎盘引起先天畸形。孕妇在病毒感染后会出现发热、流涕、头痛等上感症状，或者合并细菌感染，必须去医院就诊，如果临床医生未问明早孕病史，往往给患者服用阿司匹林、扑尔敏、四环素等药物，又增加了药物致畸的机会。

若早孕发生在空气污染较重的冬季，胎儿是缺陷儿的相对危险性明显高于其他季节。室内外空气污染与早孕胚胎致畸显著相关。冬季大气二氧化硫、总悬浮颗粒浓度最高，出生缺陷率也较其他季节为高，尤其在空气污染较重的工业城市更应注意。冬季取暖、家庭生活用燃料对出生缺陷也有影响，烧煤者出生缺陷率8.6‰，用液化气者7.4‰，用煤气者5.5‰。空气中的二氧化硫也可以使人体细胞内的遗传基因染色体发生异常，导致胎儿畸形。